最先发现新冠病毒人传人证据，赛哲生物对公共卫生有话说

文丨施燕芬

编辑丨江倩君

赛哲研发中心总监郭祥学

1月15日，广州赛哲生物科技股份有限公司（下称“赛哲生物”）收到了一份来自深圳患者的标本，经过18小时高通量测序检测，确定该患者确诊了新型冠状病毒，随即上报给广东省疾控中心和有长期合作关系的钟南山团队。相关机构立即前往深圳进行该患者的流行病学调查，调查发现本次经赛哲检测的患者近期没去过湖北，但患者有6位密切接触亲属近期从湖北返回，后续对这几位亲属进行检测呈新冠阳性。这成为了新冠病毒人传人的直接和最早证据。

1月20日，钟南山接受《新闻1+1》的采访向公众表示，新冠病毒证实存在人传人的现象。

图源：赛哲生物

赛哲为什么能成为第一？

目前在赛哲生物进行大数据和人工智能在感染性疾病的应用开发、亚洲人群感染数据库建立等工作的研发中心总监郭祥学博士，曾在美国国家疾病预防控制中心（CDC）亚特兰大总部担任生物信息主管。郭祥学向我们介绍：“赛哲生物的检测中心对外提供病原宏基因组测序服务，已累计服务超过数十万人。”成立于2010年的赛哲生物，现在已经在微生物检测行业深耕了10年。

在感染诊断领域，赛哲生物坚持多元产品战略，打通上中下游产业链：上游进行仪器试剂的研发与生产销售，中游进行基于核酸技术诊断产品的研发生产，下游进行仪器、试剂、诊断产品融合的诊断服务，形成赛哲生物在上游测序设备具有垄断地位，配合中游检测产品和下游服务的多元产品战略，打造完整的商业闭环。目前，赛哲生物的客户已经覆盖全国超过200家三甲医院、临床研究中心等，与广东省疾病预防控制中心、呼吸疾病国家重点实验室、广西疾病预防控制中心等机构展开大型科研合作项目。

赛哲生物在广州生物岛建有建地面积3000多平方米的粤港澳大湾区创新中心（广州），涵盖研发注册中心、亚洲感染疾病人工智能研究中心和体外诊断GMP生产中心和检测中心，其中研发注册中心已经开发了近100项分子诊断及特殊检测项目和30多个临床诊断试剂盒。

疫情当下，攻破病毒成为了全国头等大事。赛哲生物也积极响应了国家的号召，赛哲生物作为国际最大测序厂家illumina中国区内病原微生物唯一临床合作伙伴，依托技术和平台优势，3天内研发组建了三条检测新冠病毒不同方法的生产线，简述成18个小时、90分钟以及20分钟的检测方法。在1月20日，赛哲生物成功生产首批新冠病毒检测试剂盒，经广东省药监局推荐，国家药监局应急审批后，七天后（27日），赛哲生物便向疫区联合捐赠 12000人份新型冠状病毒检测试剂盒。截止至目前为止，赛哲累计向疫区捐出试剂盒上万份。

催生病原体AI分析平台

3月，为了满足未来突发性重大疫情的预警监测防控需求，赛哲生物向广东省疾控中心捐赠了自主研发的“iSagene”病原体AI分析平台和MiniSeq测序仪，助力广东省升级对新冠病毒（SARS-CoV-2）全面、自动、智能的监测防控能力。通过赛哲iSagene AI分析技术和机器学习，可将原来数小时的疑似或未知病源分析大大缩短至18分钟。“我们预计疫情结束后，新型冠状病毒试剂盒也可应用于每年秋冬季呼吸道感染高发期，为相关病人作新冠病毒排查。”郭祥学介绍道。

减少诊断误差、减少病原检测中的重复性工作、提高诊断效率、实现检测行业的规范化、促进药物研发，建设感染数据的智能化分析、AI辅助诊断技术是不二法门。在疫情的催化下，令AI医疗诊断行业迎来了风口。2020年第一季度，江丰生物、深至信息、医准智能等多家专注于影像诊断、药物发掘的AI医疗公司纷纷宣布融资消息。

相比于这些专注于影像诊断或从患者的病历中获取数据的“AI医生”，赛哲生物专注于整个医疗大领域中的感染领域，即病原微生物行业的人工智能诊断。微生物检测属于IVD（“in vitro diagnostic products”，中文可译为体外诊断产品）的一个细分领域，有报告显示，我国微生物检测行业2022年预计将达到30.7亿元，从2008到2022年微生物检测行业的增长已将近9.59倍，年复合增长率达到17.52%。2011年我国卫生部颁布了被称为“史上最苛刻”的《抗菌药物临床管理办法》，把微生物检测的地位提到了前所未有的高度。

“在感染领域中，只有精准诊断病原信息，才能精准地用药，没有了病原体信息，专科临床医生只能靠经验用药，而传统病原检测的阳性率只有不到20%，大多数的病原体是无法诊断出来的。”郭祥学表示，而人工智能可以在大数据中找到用药知识图谱，并对病人的耐药情况进行监控，建立规范的诊疗路径。

“iSagene”病原体AI分析平台可以依托自主病原数据库，通过机器学习，从海量病原测序数据中抽丝剥茧，精准判断病原信息和变异信息，对未知病原进行预警，对病毒流行路径进行监控。在本次新冠疫情当中，尤其体现了人工智能针对具有人传人性质的病原预警意义重大，而iSagene病原体AI分析平台通过对病毒基因序列比对，也参与了新冠病毒人传人证据的提供。

医疗人工智能，大数据先行

根据国际数据公司（IDC）的一项新研究，到2022年，机器人和人工智能等数字工作者的贡献将增长50%以上。而在公共卫生领域，较为简单和基础的自动化任务已经常见在多个医疗场景，譬如送药机器人、病例管理系统等，但人工智能还应该有更多的应用场景。

郭祥学认为：“人工智能不是空中楼阁，它需要大数据作为支撑。”它需要数据湖的建立，以实现多个维度的数据共享；需要关联医疗指标数据，开发病原微生物感染风险预测系统，预测最可疑的病原菌，提示医生关注；需要基于多点的病原微生物测序数据与病人多组学数据，开发临床诊疗路径辅助系统，根据病人目前情况预测不同诊疗路径的病情发展。

每家公司的数据库都是独有的。成立于2010年的赛哲生物，已专注病原微生物行业十个年头。对比其他依据影像学的AI医生，一直深耕数据挖掘的赛哲AI项目会从数据上对感染领域作出独有的见解。郭祥学表示：“微生物的基因复杂度远比人类基因要高，同一个感染标本，拿去不同的公司进行测序，所得的结果往往相差很大，而这是标本处理方法和数据库、算法差异所造成的。”

在数据库的建立上，赛哲生物AI项目团队正在进行多个项目，包括2000万亚洲人群感染特征数据库等。基于这些数据库，下一步赛哲将会建成iSagene病原体AI分析平台、感染疾病诊疗决策支持工具、下一代抗菌药物AI筛选平台等。已经对外进行了合共10多万例病原体宏基因组检测服务的“宏微RPD-seq®”，当中的生信分析部分正是由“iSagene”平台独立提供。

建立庞大的数据库，才能填补测序结果的差异。赛哲生物为了不断积累具有地域、专科特色的病原微生物数据库，和国内感染领域的顶尖专家进行数据库的合作共建，比如，与协和医院马小军教授在真菌数据库的合作、与呼吸疾病国家重点实验室在病毒数据库的合作、与深圳三院张国良教授在结核菌数据库的合作、与武汉同济医院器官移植研究所郭晖教授在移植感染数据库的合作等等。赛哲“iSagene”病原体AI分析平台也正是有了数据库的“数量”和“质量”保证，才能在庞杂的、变异速度快的感染诊断中保持高准确度。

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